Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ms4a6bQ99N09 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6bQ99N09 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms