Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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