Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Znf628Q8CJ78 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Znf628Q8CJ78 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf628Q8CJ78 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms