Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms