Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BcanQ61361 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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