Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PtprnQ60673 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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PtprnQ60673 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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PtprnQ60673 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprnQ60673 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms