Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsr1Q5SWD9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsr1Q5SWD9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsr1Q5SWD9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsr1Q5SWD9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsr1Q5SWD9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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