Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms