Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms