Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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