Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms