Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms