Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms