Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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