Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms