Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PtpreP49446 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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PtpreP49446 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtpreP49446 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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