Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms