Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou5f1P20263 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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