Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms