Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

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Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc6a20bO88575 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc6a20bO88575 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc6a20bO88575 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Slc6a20bO88575 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Slc6a20bO88575 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Slc6a20bO88575 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Slc6a20bO88575 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Slc6a20bO88575 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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