Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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