Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FxnO35943 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FxnO35943 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FxnO35943 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FxnO35943 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FxnO35943 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms