Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hps1O08983 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hps1O08983 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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