Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms