Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spdye4cI6XKQ3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms