Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5624F6ZZG8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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