Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem235B1AQL3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms