Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms