Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gpc6Q9R087 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gpc6Q9R087 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gpc6Q9R087 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gpc6Q9R087 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gpc6Q9R087 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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