Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Six6Q9QZ28 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Six6Q9QZ28 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Six6Q9QZ28 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Six6Q9QZ28 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Six6Q9QZ28 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Six6Q9QZ28 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Six6Q9QZ28 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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