Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms