Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms