Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Med27Q9DB40 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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