Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D9S1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D9S1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D9S1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms