Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms