Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tmem54Q9D7S1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem54Q9D7S1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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