Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx29Q9D3S3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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