Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP2Q9BX26 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms