Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms