Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp26Q99MX1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms