Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RtcbQ99LF4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RtcbQ99LF4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RtcbQ99LF4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RtcbQ99LF4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RtcbQ99LF4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RtcbQ99LF4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RtcbQ99LF4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms