Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApobrQ8VBT6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms