Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gpc3Q8CFZ4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gpc3Q8CFZ4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gpc3Q8CFZ4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gpc3Q8CFZ4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc3Q8CFZ4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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