Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms