Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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