Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms