Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rpusd2Q149F1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rpusd2Q149F1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rpusd2Q149F1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd2Q149F1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms