Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms