Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms