Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms